Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cst3P21460 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms