Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F3P20352 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F3P20352 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F3P20352 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F3P20352 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F3P20352 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
F3P20352 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
F3P20352 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F3P20352 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F3P20352 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
F3P20352 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F3P20352 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F3P20352 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F3P20352 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F3P20352 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F3P20352 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F3P20352 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F3P20352 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
F3P20352 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F3P20352 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F3P20352 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
F3P20352 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F3P20352 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms