Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NefhP19246 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NefhP19246 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NefhP19246 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NefhP19246 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NefhP19246 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NefhP19246 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms