Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifrd1P19182 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms