Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms