Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18530 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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P18530 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18530 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18530 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18530 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18530 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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