Protein–RNA interactions for Protein: P17950

Ier2, Immediate early response gene 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier2P17950 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ier2P17950 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ier2P17950 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ier2P17950 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ier2P17950 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ier2P17950 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ier2P17950 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ier2P17950 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ier2P17950 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ier2P17950 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms