Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rag1P15919 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms