Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms