Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb2P13373 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms