Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms