Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctla2aP12399 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms