Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem254aP0DN89 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms