Protein–RNA interactions for Protein: P0CG09

C2cd4d, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd4dP0CG09 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd4dP0CG09 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd4dP0CG09 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms