Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd7P0C872 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd7P0C872 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms