Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbk3P0C5K0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms