Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnfP06804 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnfP06804 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnfP06804 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms