Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcb1bP06795 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms