Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa4P06728 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms