Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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H2-Eb1P04230 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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