Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01679 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01679 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01679 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01679 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01679 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01679 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01679 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01679 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01679 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01679 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01679 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01679 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01679 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01679 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01679 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01679 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms