Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01678 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01678 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01678 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01678 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms