Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccl20O89093 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccl20O89093 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccl20O89093 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccl20O89093 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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