Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MscO88940 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MscO88940 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MscO88940 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MscO88940 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MscO88940 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms