Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme6O88425 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms