Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vti1bO88384 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms