Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nid2O88322 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nid2O88322 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nid2O88322 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms