Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt5hO55201 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms