Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja1O55176 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pja1O55176 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms