Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3O55013 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms