Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SlkO54988 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SlkO54988 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SlkO54988 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms