Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffbO54788 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DffbO54788 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffbO54788 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DffbO54788 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffbO54788 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DffbO54788 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffbO54788 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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