Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms