Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpaO35216 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpaO35216 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpaO35216 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms