Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cl1O35188 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cx3cl1O35188 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms