Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl1O09117 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms