Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casp6O08738 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casp6O08738 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms