Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm7980L7N471 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7980L7N471 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms