Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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