Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc180J3QNE4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc180J3QNE4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms