Protein–RNA interactions for Protein: J3QMJ9

Gm21800, Predicted gene, 21800, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21800J3QMJ9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21800J3QMJ9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21800J3QMJ9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms