Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm21818J3KMS6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm21818J3KMS6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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