Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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