Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms