Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms