Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms