Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2610008E11RikG3X964 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610008E11RikG3X964 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms