Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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