Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5861F6VCN9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5861F6VCN9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms