Protein–RNA interactions for Protein: F6SVV1

Gm9493, 40S ribosomal protein S7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9493F6SVV1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9493F6SVV1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9493F6SVV1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9493F6SVV1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9493F6SVV1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9493F6SVV1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms